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本局隸屬於臺北市政府,為本府一級機關,置局長1人、副局長2人、主任秘書1人、專門委員2人及簡任技正1人,下設4科1中心5室,預算員額180人,組織架構圖如下:

臺北市產業發展局組織架構圖 另開視窗-連結臺北市動物保護處  另開視窗-連結臺北市商業處  另開視窗-連結臺北市市場處  政風室  人事室  會計室  秘書室  資訊室  科技產業服務中心  農業發展科  公用事業科  工商服務科  綜合企劃科  主任秘書  副局長2人  局長

本局各單位職掌(預算員額數)如下:

  1. 局本部(13人):包含局長、副局長(2人)、主任秘書、專門委員(2人)、簡任技正、專員、秘書、科員、聘用研究員(2人)及工友共13人。
  2. 綜合企劃科(8人):產業發展策略規劃與分析、綜合管考業務、研究發展、推動為民服務、法制業務及動員防災等事項。
  3. 工商服務科(24人):工業登記與管理、動產擔保交易登記、商業行政業務及中小企業輔導業務之督導等事項。
  4. 公用事業科(27人):公用事業之監督管理、水電承裝業之管理、瓦斯裝管技工考驗、地下水與溫泉資源管理、取供事業及市場管理業務之行政督導等事項。
  5. 農業發展科(36人):農、漁事業、農民團體輔導、農業推廣、農地管理、農業資材管理、社區綠化及動物保護行政業務之督導等事項。
  6. 科技產業服務中心(21人):本市科技產業發展策略之規劃與推動、科技園區廠商服務事項及獎勵投資招商等事項。
  7. 資訊室(5人):業務資訊化作業之整體規劃、發展、協調、推動與管理維護及督導等事項。
  8. 秘書室(21人):文書、檔案、出納、總務、財產管理及不屬於其他各單位事項。
  9. 會計室(11人):歲計、會計及統計事項。
  10. 人事室(9人):人事管理事項。
  11. 政風室(5人):政風事項。